Organi združenja so skupščina, upravni odbor, programski svet in nadzorni odbor in preglednik. Skupščino sestavljajo predstavniki članov združenja in odloča o vseh zadevah, ključnih za obstoj in poslovanje Združenja. Med drugim sprejema strateške odločitve, smernice, program dela in sprejema nove člane v Zadrugo. Preglednik izvaja nadzor nad poslovanjem Zadruge, tako da med drugim nadzira materialno in finančno poslovanje, razpolaganje s sredstvi in pravilnost njihove uporabe ter sprejema letni finančni načrt in poročilo. Upravni odbor je glavni izvršilni organ Združenja, ki organizira in operativno vodi delo Zadruge in ga zastopa v javnosti.
Pogodba o ustanovitvi
Pogodba o ustanovitvi je temeljni akt zadruge, ki ureja poslovanje in delovanje zadruge. Pogodba o ustanovitvi Blockchain Alliance Europe je bila podpisana 18. 4. 2019 s strani sedmih ustanovnih članov: Viberate, Netis, Eligma, Solidum Capital, Lucis, Bonsis Cooperative ter Zeus računovodstvo in davki. Zadruga deluje demokratično.
Včlanitev
Blockchain Alliance Europe združuje pravne subjekte, ki imajo namen izvesti ali so že izvedli prvo ponudbo kripto kovancev (ICO), so že dosegli vsaj minimalni cilj ali imajo namen implementirati ali so že uspešno implementirali blockchain tehnologijo. Člane Blockchain Alliance Europe potrjuje upravni odbor zadruge, s članstvom pa se pravne osebe zavezujejo k plačevanju letne članarine in k spoštovanju določb pogodbe, internih aktov in sklepov združenja.
Kodeks
Člani zadruge so zavezani k spoštovanju kodeksa, ki določa način poslovnega vedenja članov do svojih investitorjev, javnosti in drugih članov zadruge. Od članov se pričakuje aktivna participacija, uporaba dobrih poslovnih praks in poslovne etike, spodbujanje pozitivnega poslovnega okolja in ohranjanje dobrega imena.